Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
UBR3Q6ZT12 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
UBR3Q6ZT12 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
UBR3Q6ZT12 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
UBR3Q6ZT12 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
UBR3Q6ZT12 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
UBR3Q6ZT12 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
UBR3Q6ZT12 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
UBR3Q6ZT12 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
UBR3Q6ZT12 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
UBR3Q6ZT12 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
UBR3Q6ZT12 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
UBR3Q6ZT12 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
UBR3Q6ZT12 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
UBR3Q6ZT12 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
UBR3Q6ZT12 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
UBR3Q6ZT12 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
UBR3Q6ZT12 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
UBR3Q6ZT12 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
UBR3Q6ZT12 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
UBR3Q6ZT12 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
UBR3Q6ZT12 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
UBR3Q6ZT12 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
UBR3Q6ZT12 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
UBR3Q6ZT12 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
UBR3Q6ZT12 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
UBR3Q6ZT12 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
UBR3Q6ZT12 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
UBR3Q6ZT12 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
UBR3Q6ZT12 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
UBR3Q6ZT12 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
UBR3Q6ZT12 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
UBR3Q6ZT12 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
UBR3Q6ZT12 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
UBR3Q6ZT12 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
UBR3Q6ZT12 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
UBR3Q6ZT12 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
UBR3Q6ZT12 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
UBR3Q6ZT12 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
UBR3Q6ZT12 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
UBR3Q6ZT12 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
UBR3Q6ZT12 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
UBR3Q6ZT12 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
UBR3Q6ZT12 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
UBR3Q6ZT12 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
UBR3Q6ZT12 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
UBR3Q6ZT12 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
UBR3Q6ZT12 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
UBR3Q6ZT12 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
UBR3Q6ZT12 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
UBR3Q6ZT12 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
UBR3Q6ZT12 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
UBR3Q6ZT12 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
UBR3Q6ZT12 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
UBR3Q6ZT12 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
UBR3Q6ZT12 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
UBR3Q6ZT12 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
UBR3Q6ZT12 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
UBR3Q6ZT12 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
UBR3Q6ZT12 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
UBR3Q6ZT12 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
UBR3Q6ZT12 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
UBR3Q6ZT12 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
UBR3Q6ZT12 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
UBR3Q6ZT12 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
UBR3Q6ZT12 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
UBR3Q6ZT12 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
UBR3Q6ZT12 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
UBR3Q6ZT12 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
UBR3Q6ZT12 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
UBR3Q6ZT12 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
UBR3Q6ZT12 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
UBR3Q6ZT12 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
UBR3Q6ZT12 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
UBR3Q6ZT12 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
UBR3Q6ZT12 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
UBR3Q6ZT12 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
UBR3Q6ZT12 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
UBR3Q6ZT12 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
UBR3Q6ZT12 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
UBR3Q6ZT12 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
UBR3Q6ZT12 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
UBR3Q6ZT12 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
UBR3Q6ZT12 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
UBR3Q6ZT12 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
UBR3Q6ZT12 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
UBR3Q6ZT12 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
UBR3Q6ZT12 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
UBR3Q6ZT12 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
UBR3Q6ZT12 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
UBR3Q6ZT12 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
UBR3Q6ZT12 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
UBR3Q6ZT12 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
UBR3Q6ZT12 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
UBR3Q6ZT12 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
UBR3Q6ZT12 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
UBR3Q6ZT12 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
UBR3Q6ZT12 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
UBR3Q6ZT12 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
UBR3Q6ZT12 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
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