Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSJ9

SHISA6, Protein shisa-6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA6Q6ZSJ9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHISA6Q6ZSJ9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHISA6Q6ZSJ9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHISA6Q6ZSJ9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHISA6Q6ZSJ9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHISA6Q6ZSJ9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SHISA6Q6ZSJ9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SHISA6Q6ZSJ9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SHISA6Q6ZSJ9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHISA6Q6ZSJ9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHISA6Q6ZSJ9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHISA6Q6ZSJ9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHISA6Q6ZSJ9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHISA6Q6ZSJ9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms