Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM136Q6ZRR5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM136Q6ZRR5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms