Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3E5

GDPD4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD4Q6W3E5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDPD4Q6W3E5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GDPD4Q6W3E5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDPD4Q6W3E5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDPD4Q6W3E5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms