Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXV0

GFRAL, GDNF family receptor alpha-like, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRALQ6UXV0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRALQ6UXV0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GFRALQ6UXV0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GFRALQ6UXV0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFRALQ6UXV0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRALQ6UXV0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GFRALQ6UXV0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRALQ6UXV0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRALQ6UXV0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRALQ6UXV0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFRALQ6UXV0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFRALQ6UXV0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFRALQ6UXV0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFRALQ6UXV0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GFRALQ6UXV0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GFRALQ6UXV0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GFRALQ6UXV0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFRALQ6UXV0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRALQ6UXV0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRALQ6UXV0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRALQ6UXV0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRALQ6UXV0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms