Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP8

SBSN, Suprabasin, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBSNQ6UWP8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SBSNQ6UWP8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBSNQ6UWP8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBSNQ6UWP8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBSNQ6UWP8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBSNQ6UWP8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBSNQ6UWP8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBSNQ6UWP8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBSNQ6UWP8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBSNQ6UWP8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBSNQ6UWP8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBSNQ6UWP8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBSNQ6UWP8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBSNQ6UWP8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBSNQ6UWP8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBSNQ6UWP8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBSNQ6UWP8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SBSNQ6UWP8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SBSNQ6UWP8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SBSNQ6UWP8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SBSNQ6UWP8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SBSNQ6UWP8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms