Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCIMPQ6UWF3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCIMPQ6UWF3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms