Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRAIDQ6UW56 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATRAIDQ6UW56 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATRAIDQ6UW56 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms