Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ZBED9Q6R2W3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ZBED9Q6R2W3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ZBED9Q6R2W3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ZBED9Q6R2W3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ZBED9Q6R2W3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZBED9Q6R2W3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZBED9Q6R2W3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
ZBED9Q6R2W3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZBED9Q6R2W3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZBED9Q6R2W3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZBED9Q6R2W3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZBED9Q6R2W3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZBED9Q6R2W3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZBED9Q6R2W3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZBED9Q6R2W3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZBED9Q6R2W3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZBED9Q6R2W3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
ZBED9Q6R2W3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZBED9Q6R2W3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZBED9Q6R2W3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZBED9Q6R2W3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZBED9Q6R2W3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZBED9Q6R2W3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZBED9Q6R2W3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZBED9Q6R2W3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
ZBED9Q6R2W3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ZBED9Q6R2W3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms