Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TXNDC11Q6PKC3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNDC11Q6PKC3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TXNDC11Q6PKC3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms