Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA3EQ6PEY2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBA3EQ6PEY2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms