Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKN3Q6P5Z2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PKN3Q6P5Z2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PKN3Q6P5Z2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKN3Q6P5Z2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms