Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
REEP3Q6NUK4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
REEP3Q6NUK4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms