Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN13Q6MZZ7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN13Q6MZZ7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms