Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV3

PTRHD1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRHD1Q6GMV3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTRHD1Q6GMV3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTRHD1Q6GMV3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTRHD1Q6GMV3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTRHD1Q6GMV3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTRHD1Q6GMV3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTRHD1Q6GMV3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTRHD1Q6GMV3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTRHD1Q6GMV3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTRHD1Q6GMV3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTRHD1Q6GMV3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTRHD1Q6GMV3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTRHD1Q6GMV3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTRHD1Q6GMV3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTRHD1Q6GMV3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTRHD1Q6GMV3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTRHD1Q6GMV3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTRHD1Q6GMV3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTRHD1Q6GMV3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTRHD1Q6GMV3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTRHD1Q6GMV3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTRHD1Q6GMV3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTRHD1Q6GMV3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTRHD1Q6GMV3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTRHD1Q6GMV3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTRHD1Q6GMV3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTRHD1Q6GMV3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTRHD1Q6GMV3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTRHD1Q6GMV3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTRHD1Q6GMV3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTRHD1Q6GMV3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTRHD1Q6GMV3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTRHD1Q6GMV3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTRHD1Q6GMV3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTRHD1Q6GMV3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTRHD1Q6GMV3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTRHD1Q6GMV3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTRHD1Q6GMV3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTRHD1Q6GMV3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms