Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CARMIL2Q6F5E8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CARMIL2Q6F5E8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CARMIL2Q6F5E8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CARMIL2Q6F5E8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CARMIL2Q6F5E8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
CARMIL2Q6F5E8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
CARMIL2Q6F5E8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
CARMIL2Q6F5E8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
CARMIL2Q6F5E8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
CARMIL2Q6F5E8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
CARMIL2Q6F5E8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
CARMIL2Q6F5E8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
CARMIL2Q6F5E8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC39.74■■■■□ 3.95
CARMIL2Q6F5E8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
CARMIL2Q6F5E8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.74■■■■□ 3.95
CARMIL2Q6F5E8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
CARMIL2Q6F5E8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
CARMIL2Q6F5E8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CARMIL2Q6F5E8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CARMIL2Q6F5E8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CARMIL2Q6F5E8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CARMIL2Q6F5E8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CARMIL2Q6F5E8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
CARMIL2Q6F5E8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CARMIL2Q6F5E8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CARMIL2Q6F5E8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CARMIL2Q6F5E8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
CARMIL2Q6F5E8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
CARMIL2Q6F5E8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
CARMIL2Q6F5E8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
CARMIL2Q6F5E8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
CARMIL2Q6F5E8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CARMIL2Q6F5E8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CARMIL2Q6F5E8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CARMIL2Q6F5E8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CARMIL2Q6F5E8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CARMIL2Q6F5E8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
CARMIL2Q6F5E8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CARMIL2Q6F5E8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CARMIL2Q6F5E8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CARMIL2Q6F5E8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
CARMIL2Q6F5E8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
CARMIL2Q6F5E8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
CARMIL2Q6F5E8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CARMIL2Q6F5E8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CARMIL2Q6F5E8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
CARMIL2Q6F5E8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
CARMIL2Q6F5E8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
CARMIL2Q6F5E8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
CARMIL2Q6F5E8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
CARMIL2Q6F5E8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
CARMIL2Q6F5E8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
CARMIL2Q6F5E8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CARMIL2Q6F5E8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
CARMIL2Q6F5E8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
CARMIL2Q6F5E8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
CARMIL2Q6F5E8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CARMIL2Q6F5E8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
CARMIL2Q6F5E8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
CARMIL2Q6F5E8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CARMIL2Q6F5E8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
CARMIL2Q6F5E8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
CARMIL2Q6F5E8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
CARMIL2Q6F5E8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
CARMIL2Q6F5E8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
CARMIL2Q6F5E8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
CARMIL2Q6F5E8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CARMIL2Q6F5E8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CARMIL2Q6F5E8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CARMIL2Q6F5E8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CARMIL2Q6F5E8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CARMIL2Q6F5E8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CARMIL2Q6F5E8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CARMIL2Q6F5E8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CARMIL2Q6F5E8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC39.51■■■■□ 3.91
CARMIL2Q6F5E8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CARMIL2Q6F5E8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CARMIL2Q6F5E8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
CARMIL2Q6F5E8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
CARMIL2Q6F5E8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
CARMIL2Q6F5E8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CARMIL2Q6F5E8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
CARMIL2Q6F5E8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CARMIL2Q6F5E8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CARMIL2Q6F5E8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
CARMIL2Q6F5E8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
CARMIL2Q6F5E8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
CARMIL2Q6F5E8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
CARMIL2Q6F5E8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
CARMIL2Q6F5E8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
CARMIL2Q6F5E8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
CARMIL2Q6F5E8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
CARMIL2Q6F5E8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
CARMIL2Q6F5E8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC39.45■■■■□ 3.91
CARMIL2Q6F5E8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.5 ms