Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATL3Q6DD88 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATL3Q6DD88 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms