Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms