Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV0

FOXB2, Forkhead box protein B2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXB2Q5VYV0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXB2Q5VYV0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXB2Q5VYV0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXB2Q5VYV0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXB2Q5VYV0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms