Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPATA1Q5VX52 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPATA1Q5VX52 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.3 ms