Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOCADQ5VW36 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOCADQ5VW36 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOCADQ5VW36 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOCADQ5VW36 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOCADQ5VW36 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOCADQ5VW36 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOCADQ5VW36 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOCADQ5VW36 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOCADQ5VW36 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOCADQ5VW36 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOCADQ5VW36 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOCADQ5VW36 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOCADQ5VW36 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOCADQ5VW36 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOCADQ5VW36 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOCADQ5VW36 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FOCADQ5VW36 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FOCADQ5VW36 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FOCADQ5VW36 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FOCADQ5VW36 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FOCADQ5VW36 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FOCADQ5VW36 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FOCADQ5VW36 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FOCADQ5VW36 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FOCADQ5VW36 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FOCADQ5VW36 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FOCADQ5VW36 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms