Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
C1orf53Q5VUE5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C1orf53Q5VUE5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C1orf53Q5VUE5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C1orf53Q5VUE5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
C1orf53Q5VUE5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C1orf53Q5VUE5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C1orf53Q5VUE5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C1orf53Q5VUE5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C1orf53Q5VUE5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C1orf53Q5VUE5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C1orf53Q5VUE5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C1orf53Q5VUE5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C1orf53Q5VUE5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C1orf53Q5VUE5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C1orf53Q5VUE5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
C1orf53Q5VUE5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C1orf53Q5VUE5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C1orf53Q5VUE5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C1orf53Q5VUE5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C1orf53Q5VUE5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
C1orf53Q5VUE5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms