Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CROCCQ5TZA2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CROCCQ5TZA2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CROCCQ5TZA2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CROCCQ5TZA2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CROCCQ5TZA2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CROCCQ5TZA2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CROCCQ5TZA2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CROCCQ5TZA2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CROCCQ5TZA2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CROCCQ5TZA2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CROCCQ5TZA2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CROCCQ5TZA2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CROCCQ5TZA2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CROCCQ5TZA2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CROCCQ5TZA2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CROCCQ5TZA2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CROCCQ5TZA2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CROCCQ5TZA2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CROCCQ5TZA2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CROCCQ5TZA2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CROCCQ5TZA2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROCCQ5TZA2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CROCCQ5TZA2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms