Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRAMEF5Q5TYX0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF5Q5TYX0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms