Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HES3Q5TGS1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HES3Q5TGS1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HES3Q5TGS1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms