Protein–RNA interactions for Protein: Q5TA50

CPTP, Ceramide-1-phosphate transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPTPQ5TA50 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPTPQ5TA50 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPTPQ5TA50 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPTPQ5TA50 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPTPQ5TA50 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPTPQ5TA50 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPTPQ5TA50 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPTPQ5TA50 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPTPQ5TA50 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPTPQ5TA50 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPTPQ5TA50 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPTPQ5TA50 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPTPQ5TA50 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPTPQ5TA50 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPTPQ5TA50 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms