Protein–RNA interactions for Protein: Q5T481

RBM20, RNA-binding protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM20Q5T481 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM20Q5T481 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM20Q5T481 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM20Q5T481 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms