Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HIVEP3Q5T1R4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIVEP3Q5T1R4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIVEP3Q5T1R4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIVEP3Q5T1R4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIVEP3Q5T1R4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIVEP3Q5T1R4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HIVEP3Q5T1R4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HIVEP3Q5T1R4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIVEP3Q5T1R4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HIVEP3Q5T1R4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIVEP3Q5T1R4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HIVEP3Q5T1R4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIVEP3Q5T1R4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIVEP3Q5T1R4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIVEP3Q5T1R4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HIVEP3Q5T1R4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIVEP3Q5T1R4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIVEP3Q5T1R4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HIVEP3Q5T1R4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIVEP3Q5T1R4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIVEP3Q5T1R4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIVEP3Q5T1R4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HIVEP3Q5T1R4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
HIVEP3Q5T1R4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIVEP3Q5T1R4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms