Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
TTC39AQ5SRH9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
TTC39AQ5SRH9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TTC39AQ5SRH9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TTC39AQ5SRH9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TTC39AQ5SRH9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TTC39AQ5SRH9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TTC39AQ5SRH9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTC39AQ5SRH9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTC39AQ5SRH9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTC39AQ5SRH9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTC39AQ5SRH9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TTC39AQ5SRH9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TTC39AQ5SRH9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TTC39AQ5SRH9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TTC39AQ5SRH9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TTC39AQ5SRH9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TTC39AQ5SRH9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTC39AQ5SRH9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTC39AQ5SRH9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTC39AQ5SRH9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTC39AQ5SRH9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TTC39AQ5SRH9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TTC39AQ5SRH9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TTC39AQ5SRH9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TTC39AQ5SRH9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TTC39AQ5SRH9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TTC39AQ5SRH9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TTC39AQ5SRH9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TTC39AQ5SRH9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TTC39AQ5SRH9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TTC39AQ5SRH9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TTC39AQ5SRH9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TTC39AQ5SRH9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.9 ms