Protein–RNA interactions for Protein: Q5JX71

FAM209A, Protein FAM209A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM209AQ5JX71 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM209AQ5JX71 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM209AQ5JX71 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM209AQ5JX71 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM209AQ5JX71 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM209AQ5JX71 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM209AQ5JX71 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM209AQ5JX71 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM209AQ5JX71 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM209AQ5JX71 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM209AQ5JX71 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM209AQ5JX71 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM209AQ5JX71 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM209AQ5JX71 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM209AQ5JX71 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM209AQ5JX71 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM209AQ5JX71 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM209AQ5JX71 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM209AQ5JX71 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM209AQ5JX71 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM209AQ5JX71 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms