Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRA6

MIA3, Transport and Golgi organization protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3Q5JRA6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIA3Q5JRA6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
MIA3Q5JRA6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms