Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NOM1Q5C9Z4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NOM1Q5C9Z4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NOM1Q5C9Z4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms