Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
PHLDA2Q53GA4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1245.8 ms