Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC36A3Q495N2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC36A3Q495N2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms