Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXP7

KIAA1644, Uncharacterized protein KIAA1644, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1644Q3SXP7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1644Q3SXP7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1644Q3SXP7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1644Q3SXP7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1644Q3SXP7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1644Q3SXP7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1644Q3SXP7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1644Q3SXP7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1644Q3SXP7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1644Q3SXP7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1644Q3SXP7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIAA1644Q3SXP7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIAA1644Q3SXP7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIAA1644Q3SXP7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1644Q3SXP7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1644Q3SXP7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms