Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H1Q32P28 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H1Q32P28 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H1Q32P28 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H1Q32P28 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
P3H1Q32P28 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
P3H1Q32P28 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
P3H1Q32P28 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
P3H1Q32P28 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
P3H1Q32P28 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
P3H1Q32P28 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
P3H1Q32P28 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
P3H1Q32P28 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
P3H1Q32P28 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
P3H1Q32P28 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
P3H1Q32P28 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
P3H1Q32P28 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
P3H1Q32P28 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
P3H1Q32P28 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.4 ms