Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSR1Q2NL82 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSR1Q2NL82 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSR1Q2NL82 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms