Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MICBQ29980 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MICBQ29980 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MICBQ29980 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MICBQ29980 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MICBQ29980 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MICBQ29980 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MICBQ29980 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MICBQ29980 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MICBQ29980 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MICBQ29980 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MICBQ29980 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MICBQ29980 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MICBQ29980 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MICBQ29980 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MICBQ29980 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MICBQ29980 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MICBQ29980 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MICBQ29980 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MICBQ29980 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MICBQ29980 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MICBQ29980 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MICBQ29980 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MICBQ29980 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MICBQ29980 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MICBQ29980 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MICBQ29980 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MICBQ29980 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MICBQ29980 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MICBQ29980 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MICBQ29980 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MICBQ29980 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MICBQ29980 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MICBQ29980 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MICBQ29980 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MICBQ29980 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MICBQ29980 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MICBQ29980 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MICBQ29980 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MICBQ29980 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MICBQ29980 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MICBQ29980 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MICBQ29980 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MICBQ29980 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MICBQ29980 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MICBQ29980 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MICBQ29980 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MICBQ29980 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MICBQ29980 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MICBQ29980 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MICBQ29980 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MICBQ29980 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MICBQ29980 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MICBQ29980 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MICBQ29980 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MICBQ29980 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MICBQ29980 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MICBQ29980 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MICBQ29980 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MICBQ29980 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MICBQ29980 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MICBQ29980 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MICBQ29980 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MICBQ29980 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MICBQ29980 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MICBQ29980 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MICBQ29980 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MICBQ29980 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MICBQ29980 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MICBQ29980 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MICBQ29980 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MICBQ29980 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MICBQ29980 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MICBQ29980 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MICBQ29980 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MICBQ29980 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MICBQ29980 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MICBQ29980 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MICBQ29980 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MICBQ29980 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MICBQ29980 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MICBQ29980 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MICBQ29980 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MICBQ29980 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MICBQ29980 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MICBQ29980 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MICBQ29980 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MICBQ29980 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MICBQ29980 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MICBQ29980 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MICBQ29980 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MICBQ29980 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MICBQ29980 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MICBQ29980 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MICBQ29980 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MICBQ29980 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MICBQ29980 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MICBQ29980 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MICBQ29980 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MICBQ29980 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms