Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLPPQ16740 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
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