Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
FOXD1Q16676 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
FOXD1Q16676 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
FOXD1Q16676 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
FOXD1Q16676 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
FOXD1Q16676 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FOXD1Q16676 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FOXD1Q16676 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FOXD1Q16676 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FOXD1Q16676 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
FOXD1Q16676 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
FOXD1Q16676 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
FOXD1Q16676 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
FOXD1Q16676 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
FOXD1Q16676 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
FOXD1Q16676 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
FOXD1Q16676 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FOXD1Q16676 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FOXD1Q16676 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
FOXD1Q16676 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
FOXD1Q16676 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
FOXD1Q16676 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
FOXD1Q16676 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
FOXD1Q16676 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
FOXD1Q16676 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
FOXD1Q16676 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
FOXD1Q16676 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
FOXD1Q16676 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36■■■■□ 3.35
FOXD1Q16676 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
FOXD1Q16676 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
FOXD1Q16676 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
FOXD1Q16676 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
FOXD1Q16676 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
FOXD1Q16676 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
FOXD1Q16676 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
FOXD1Q16676 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
FOXD1Q16676 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
FOXD1Q16676 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
FOXD1Q16676 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
FOXD1Q16676 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
FOXD1Q16676 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
FOXD1Q16676 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
FOXD1Q16676 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
FOXD1Q16676 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
FOXD1Q16676 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
FOXD1Q16676 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
FOXD1Q16676 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
FOXD1Q16676 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms