Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF9Q16594 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF9Q16594 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms