Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DDB1Q16531 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DDB1Q16531 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DDB1Q16531 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DDB1Q16531 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DDB1Q16531 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DDB1Q16531 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
DDB1Q16531 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
DDB1Q16531 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
DDB1Q16531 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
DDB1Q16531 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
DDB1Q16531 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DDB1Q16531 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
DDB1Q16531 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
DDB1Q16531 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
DDB1Q16531 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
DDB1Q16531 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DDB1Q16531 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DDB1Q16531 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
DDB1Q16531 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
DDB1Q16531 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
DDB1Q16531 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
DDB1Q16531 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
DDB1Q16531 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DDB1Q16531 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
DDB1Q16531 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DDB1Q16531 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
DDB1Q16531 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DDB1Q16531 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DDB1Q16531 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
DDB1Q16531 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
DDB1Q16531 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
DDB1Q16531 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DDB1Q16531 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
DDB1Q16531 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
DDB1Q16531 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
DDB1Q16531 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
DDB1Q16531 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
DDB1Q16531 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
DDB1Q16531 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
DDB1Q16531 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
DDB1Q16531 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
DDB1Q16531 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
DDB1Q16531 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
DDB1Q16531 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
DDB1Q16531 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
DDB1Q16531 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
DDB1Q16531 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
DDB1Q16531 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DDB1Q16531 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DDB1Q16531 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DDB1Q16531 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
DDB1Q16531 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
DDB1Q16531 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
DDB1Q16531 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
DDB1Q16531 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
DDB1Q16531 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
DDB1Q16531 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
DDB1Q16531 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
DDB1Q16531 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
DDB1Q16531 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
DDB1Q16531 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
DDB1Q16531 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
DDB1Q16531 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
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