Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCD2Q16342 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDCD2Q16342 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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