Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CHRNA2Q15822 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CHRNA2Q15822 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CHRNA2Q15822 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CHRNA2Q15822 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CHRNA2Q15822 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CHRNA2Q15822 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHRNA2Q15822 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHRNA2Q15822 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHRNA2Q15822 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHRNA2Q15822 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHRNA2Q15822 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHRNA2Q15822 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHRNA2Q15822 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CHRNA2Q15822 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHRNA2Q15822 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CHRNA2Q15822 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CHRNA2Q15822 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CHRNA2Q15822 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CHRNA2Q15822 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHRNA2Q15822 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHRNA2Q15822 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHRNA2Q15822 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHRNA2Q15822 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHRNA2Q15822 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHRNA2Q15822 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CHRNA2Q15822 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHRNA2Q15822 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHRNA2Q15822 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHRNA2Q15822 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHRNA2Q15822 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHRNA2Q15822 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHRNA2Q15822 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHRNA2Q15822 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHRNA2Q15822 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHRNA2Q15822 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHRNA2Q15822 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHRNA2Q15822 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHRNA2Q15822 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHRNA2Q15822 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHRNA2Q15822 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHRNA2Q15822 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CHRNA2Q15822 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CHRNA2Q15822 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CHRNA2Q15822 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHRNA2Q15822 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHRNA2Q15822 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHRNA2Q15822 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHRNA2Q15822 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHRNA2Q15822 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CHRNA2Q15822 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CHRNA2Q15822 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHRNA2Q15822 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHRNA2Q15822 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHRNA2Q15822 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHRNA2Q15822 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CHRNA2Q15822 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHRNA2Q15822 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHRNA2Q15822 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHRNA2Q15822 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHRNA2Q15822 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHRNA2Q15822 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHRNA2Q15822 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHRNA2Q15822 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CHRNA2Q15822 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CHRNA2Q15822 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CHRNA2Q15822 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHRNA2Q15822 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHRNA2Q15822 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHRNA2Q15822 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHRNA2Q15822 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHRNA2Q15822 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHRNA2Q15822 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHRNA2Q15822 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHRNA2Q15822 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHRNA2Q15822 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CHRNA2Q15822 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHRNA2Q15822 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHRNA2Q15822 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHRNA2Q15822 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHRNA2Q15822 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHRNA2Q15822 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHRNA2Q15822 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHRNA2Q15822 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHRNA2Q15822 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHRNA2Q15822 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CHRNA2Q15822 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CHRNA2Q15822 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CHRNA2Q15822 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHRNA2Q15822 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHRNA2Q15822 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHRNA2Q15822 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CHRNA2Q15822 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHRNA2Q15822 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHRNA2Q15822 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHRNA2Q15822 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHRNA2Q15822 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CHRNA2Q15822 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHRNA2Q15822 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHRNA2Q15822 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms