Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD1Q15797 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMAD1Q15797 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD1Q15797 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD1Q15797 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD1Q15797 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD1Q15797 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD1Q15797 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD1Q15797 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD1Q15797 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD1Q15797 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD1Q15797 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD1Q15797 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD1Q15797 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD1Q15797 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD1Q15797 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD1Q15797 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD1Q15797 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMAD1Q15797 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD1Q15797 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD1Q15797 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD1Q15797 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD1Q15797 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD1Q15797 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD1Q15797 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMAD1Q15797 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
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