Protein–RNA interactions for Protein: Q15583

TGIF1, Homeobox protein TGIF1, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF1Q15583 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TGIF1Q15583 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TGIF1Q15583 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TGIF1Q15583 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGIF1Q15583 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGIF1Q15583 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGIF1Q15583 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGIF1Q15583 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGIF1Q15583 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGIF1Q15583 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGIF1Q15583 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGIF1Q15583 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGIF1Q15583 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGIF1Q15583 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TGIF1Q15583 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGIF1Q15583 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TGIF1Q15583 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TGIF1Q15583 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGIF1Q15583 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGIF1Q15583 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGIF1Q15583 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGIF1Q15583 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGIF1Q15583 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGIF1Q15583 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGIF1Q15583 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGIF1Q15583 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGIF1Q15583 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGIF1Q15583 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGIF1Q15583 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGIF1Q15583 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGIF1Q15583 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGIF1Q15583 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGIF1Q15583 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TGIF1Q15583 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGIF1Q15583 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGIF1Q15583 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGIF1Q15583 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGIF1Q15583 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGIF1Q15583 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGIF1Q15583 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGIF1Q15583 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGIF1Q15583 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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