Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF4Q15306 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF4Q15306 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
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