Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5R1Q15078 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5R1Q15078 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5R1Q15078 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5R1Q15078 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5R1Q15078 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5R1Q15078 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5R1Q15078 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5R1Q15078 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5R1Q15078 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5R1Q15078 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5R1Q15078 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5R1Q15078 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5R1Q15078 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5R1Q15078 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5R1Q15078 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5R1Q15078 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5R1Q15078 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5R1Q15078 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5R1Q15078 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5R1Q15078 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5R1Q15078 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5R1Q15078 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK5R1Q15078 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5R1Q15078 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5R1Q15078 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5R1Q15078 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5R1Q15078 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5R1Q15078 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5R1Q15078 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5R1Q15078 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5R1Q15078 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5R1Q15078 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5R1Q15078 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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