Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCAPHQ15003 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCAPHQ15003 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCAPHQ15003 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCAPHQ15003 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCAPHQ15003 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCAPHQ15003 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCAPHQ15003 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCAPHQ15003 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCAPHQ15003 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCAPHQ15003 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCAPHQ15003 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCAPHQ15003 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCAPHQ15003 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCAPHQ15003 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCAPHQ15003 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCAPHQ15003 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCAPHQ15003 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCAPHQ15003 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCAPHQ15003 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCAPHQ15003 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCAPHQ15003 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCAPHQ15003 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NCAPHQ15003 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NCAPHQ15003 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCAPHQ15003 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCAPHQ15003 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCAPHQ15003 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCAPHQ15003 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NCAPHQ15003 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NCAPHQ15003 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCAPHQ15003 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NCAPHQ15003 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPHQ15003 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPHQ15003 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPHQ15003 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPHQ15003 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPHQ15003 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPHQ15003 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPHQ15003 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPHQ15003 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPHQ15003 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPHQ15003 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPHQ15003 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCAPHQ15003 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCAPHQ15003 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NCAPHQ15003 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NCAPHQ15003 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NCAPHQ15003 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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