Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCARF1Q14162 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCARF1Q14162 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCARF1Q14162 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCARF1Q14162 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCARF1Q14162 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SCARF1Q14162 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SCARF1Q14162 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SCARF1Q14162 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCARF1Q14162 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCARF1Q14162 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCARF1Q14162 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCARF1Q14162 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCARF1Q14162 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCARF1Q14162 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCARF1Q14162 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCARF1Q14162 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SCARF1Q14162 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCARF1Q14162 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SCARF1Q14162 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCARF1Q14162 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCARF1Q14162 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SCARF1Q14162 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SCARF1Q14162 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCARF1Q14162 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SCARF1Q14162 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SCARF1Q14162 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SCARF1Q14162 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SCARF1Q14162 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SCARF1Q14162 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SCARF1Q14162 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SCARF1Q14162 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SCARF1Q14162 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCARF1Q14162 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCARF1Q14162 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCARF1Q14162 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCARF1Q14162 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCARF1Q14162 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCARF1Q14162 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SCARF1Q14162 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCARF1Q14162 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
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